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実践系枠はPart 1, 2 の計2部(3コマ)で行われます。
Part1はかずさDNA研究所の中村保一先生で2コマ、 Part2は埼玉医科大学の坊農秀雅先生に講師をお願いしています。 それぞれ内容は異なり、1コマだけでも、全3コマでも参加できます。 |
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Part1 コピペ系バイオインフォから脱皮しよう!生化学者のためのバイオインフォ使いこなし |
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中村保一先生 【要旨】 |
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- <1コマ目>(19日10:30〜) ※開校式の前となりますのでご注意ください。
内容:MacOS Xに様々なバイオインフォのツールを セットアップします。
あなたのコンピュータでBLASTが動き出し、注目する遺伝子の本当の姿が見えてきます。 |
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- <2コマ目>(19日14:00〜) ※19日の他のWS枠と重なりますのでご注意ください。
内容:なぜMacOS Xか?から始まり、配列解析の基本から、ncbitoolsやemboss、ゲノムデータ等の保守管理の仕方、各ツールの連携までを実習。最終的には、同じモチーフを持つ配 列の系統樹を描く、目的のprimerをつくるなどを目指す。 |
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Part2 マイクロアレイデータ解析編
〜遺伝子発現の in silico 予測とゲノムワイドな発現情報の比較〜 |
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坊農秀雅先生 【要旨】 |
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- (21日15:00〜) ※閉校式の後となりますのでご注意ください。
内容:公開されているマイクロアレーデータの検索とその利用法について実習し、さらに実際の研究例を取り上げる。 |
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○使用端末とMacOS Xの貸し出しについて |
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- Part1は基本的にはMacOS Xを使用し、Part2では MacOS XまたはWindowsのパソコンを使用し、実習を行います。特 にPart1の1コマ目はMacOS Xへのインストールが中 心となるため、手元にMacOS Xのパソコンがないと楽しむことができない可能性があります。(Windows機への各ツール導入につきましては、個別にご相談ください。)
ご好評につきApple社のご協賛による Mac端末のお貸し出しは規定数に達しましたので、募集を締め切らせて頂 きます。
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○備考 |
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- それぞれ、ご期待に添えない場合等や、開催前の連絡事項を登録アド レスにe-mailにて連絡させていただきたいと考えております。実 践系WSにお申し込みの方はなるべく頻繁な(週に2回 以上)メールチェックをお願いいたします。 |
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